Mengetahui cuaca sebelum berangkat akan membuat perjalanan Anda mengelilingi Saparua lebih santai dan menyenangkan, khususnya jika Anda ingin menjelajahi banyak tempat. Periode dengan suhu terpanas biasanya jatuh antara Januari dan Desember dengan suhu rata-rata 27°C, sementara periode terdingin antara Agustus dan September dengan suhu rata-rata 25°C. Curah hujan terbesar di Saparua ada pada bulan Maret, Mei, Juli, dan April, dengan rata-rata per bulan 346 cm curah hujan.