Periode dengan suhu terpanas biasanya jatuh antara Mei dan Agustus dengan suhu rata-rata 26°C, sementara periode terdingin antara Februari dan Juli dengan suhu rata-rata 25°C. Curah hujan terbesar di Entikong ada pada bulan Desember, November, Januari, dan Oktober, dengan rata-rata per bulan 417 cm curah hujan.