Cuaca bisa jadi faktor utama saat Anda merencanakan liburan ke Nilo Peçanha, dan perlu diingat bahwa opsi yang lebih murah biasanya tersedia saat cuaca sedang tidak bagus. Periode dengan suhu terpanas biasanya jatuh antara Februari dan Januari dengan suhu rata-rata 26°C, sementara periode terdingin antara Juli dan Agustus dengan suhu rata-rata 21°C. Curah hujan terbesar di Nilo Peçanha ada pada bulan Januari, Desember, November, dan Maret, dengan rata-rata per bulan 210 cm curah hujan.