Walaupun cuaca hanya merupakan satu faktor, itu dapat memengaruhi rencana liburan Anda, khususnya saat Anda berencana untuk tinggal lebih lama di Yasuni. Periode dengan suhu terpanas biasanya jatuh antara September dan Oktober dengan suhu rata-rata 25°C, sementara periode terdingin antara Juli dan Juni dengan suhu rata-rata 24°C. Curah hujan terbesar di Yasuni ada pada bulan Maret, Juni, Mei, dan April, dengan rata-rata per bulan 411 cm curah hujan.