Saat Anda hendak merencanakan perjalanan ke El Ayote, pastikan untuk mengetahui suhu tahunan di sana. Periode dengan suhu terpanas biasanya jatuh antara April dan Maret dengan suhu rata-rata 26°C, sementara periode terdingin antara Januari dan Februari dengan suhu rata-rata 24°C. Curah hujan terbesar di El Ayote ada pada bulan Oktober, Mei, Juni, dan September, dengan rata-rata per bulan 256 cm curah hujan.