Cuaca bisa jadi faktor utama saat Anda merencanakan liburan ke Pulau Rote, dan perlu diingat bahwa opsi yang lebih murah biasanya tersedia saat cuaca sedang tidak bagus. Periode dengan suhu terpanas biasanya jatuh antara November dan Desember dengan suhu rata-rata 29°C, sementara periode terdingin antara Agustus dan Juli dengan suhu rata-rata 27°C. Curah hujan terbesar di Pulau Rote ada pada bulan Januari, Februari, Desember, dan Maret, dengan rata-rata per bulan 231 cm curah hujan.