Cuaca bisa jadi faktor utama saat Anda merencanakan liburan ke Ternate, dan perlu diingat bahwa opsi yang lebih murah biasanya tersedia saat cuaca sedang tidak bagus. Periode dengan suhu terpanas biasanya jatuh antara Mei dan November dengan suhu rata-rata 27°C, sementara periode terdingin antara Juli dan Agustus dengan suhu rata-rata 27°C. Curah hujan terbesar di Ternate ada pada bulan Juni, Mei, Juli, dan Desember, dengan rata-rata per bulan 331 cm curah hujan.