Mengetahui cuaca sebelum berangkat akan membuat perjalanan Anda mengelilingi Encarnacion lebih santai dan menyenangkan, khususnya jika Anda ingin menjelajahi banyak tempat. Periode dengan suhu terpanas biasanya jatuh antara Januari dan Februari dengan suhu rata-rata 26°C, sementara periode terdingin antara Juli dan Juni dengan suhu rata-rata 17°C. Curah hujan terbesar di Encarnacion ada pada bulan Oktober, Mei, November, dan Desember, dengan rata-rata per bulan 205 cm curah hujan.