Cuaca memiliki peranan penting saat Anda merencanakan liburan ke Magetan, dan perlu diingat bahwa opsi yang lebih murah biasanya tersedia saat cuaca sedang tidak bagus. Periode dengan suhu terpanas biasanya jatuh antara Oktober dan September dengan suhu rata-rata 27°C, sementara periode terdingin antara Juli dan Agustus dengan suhu rata-rata 26°C. Curah hujan terbesar di Magetan ada pada bulan Februari, Maret, Desember, dan Januari, dengan rata-rata per bulan 403 cm curah hujan.