Mengetahui cuaca sebelum berangkat akan membuat perjalanan Anda mengelilingi Manokwari lebih santai dan menyenangkan, khususnya jika Anda ingin menjelajahi banyak tempat. Periode dengan suhu terpanas biasanya jatuh antara Oktober dan Mei dengan suhu rata-rata 27°C, sementara periode terdingin antara Agustus dan Juli dengan suhu rata-rata 26°C. Curah hujan terbesar di Manokwari ada pada bulan April, Maret, Januari, dan Desember, dengan rata-rata per bulan 379 cm curah hujan.
