Mengetahui cuaca sebelum berangkat akan membuat perjalanan Anda mengelilingi Taketomi lebih santai dan menyenangkan, khususnya jika Anda ingin menjelajahi banyak tempat. Periode dengan suhu terpanas biasanya jatuh antara Juli dan Agustus dengan suhu rata-rata 29°C, sementara periode terdingin antara Januari dan Februari dengan suhu rata-rata 20°C. Curah hujan terbesar di Taketomi ada pada bulan Agustus, September, Mei, dan Juni, dengan rata-rata per bulan 263 cm curah hujan.